學術界翻牆的重要性不言而喻
今天林口長庚檢驗醫學部的晨會針對武漢肺炎討論許久,相對於2003年時面對SARS的工具非常有限,如今的技術進步許多,一個多月能取得病原菌的基因定序,五天內取得完整的病毒株品系分析和具特異性的RT-PCR引子設計序列,預計幾天內林長科內也能在疾病管制局的分配下取得分子檢驗相關的試劑。
這次對於武漢肺炎背後致病病毒辨識速度很快,來自於參與的科學家及研究人員很願意分享,基本上這次病毒的序列探索和檢測工具是一系列在社交軟體上串連的合作,非常不可思議!
一開始是由上海復旦大學張永振教授和澳洲西尼大學的Edward Holmes教授在Twitter上貼出其上傳序列的網址,底下開始討論起這隻病毒的核酸序列,緊接者Open Science Prize獎得主Nextstrain的團隊分享其針對這隻病毒序列的親緣分析,看出其跟SARS病毒株都在beta-cov lineage上,但不相同,緊接者德國柏林病毒學家Victor Max Corman發表其針對這序列所設計的RT-PCR引子,不久就被WHO納入作為實驗室檢驗這支新型冠狀病毒的指引,這風氣其實就是生物資訊領域們的同好因擁抱開放所能享有的價值,在這次的病毒爆發事件中扮演重要的角色!
雖然手上的檢驗工具因科技進步很快取得,但良好的防疫策略和病毒特性也相當重要,相信接下來的過年的人口大遷移將是會一個挑戰!
其實每年這個時候都是感冒流行期,而俗稱的感冒(Common cold),通常會有上呼吸道的癥狀包括流鼻涕(Rhinorrhea)、鼻塞(Nasal obstruction),伴隨者喉嚨痛(Sore throat)、打噴嚏(Sneezing)和咳嗽(Cough),這算是人類最常見的疾病,而大概2/3到3/4都是因病毒感染造成的,絕大多數感冒都是不致命的,就是具有自限性,但在免疫力低下的族群則會有比較嚴重的影響,所以如何控制住病毒的傳播就變成防疫重要的要點。
這群病毒的種類其實非常多,而這次武漢肺炎的病毒則是屬於冠狀病毒,此類病毒在2003 SARS風暴以前是沒什麼關注的,仔細來說,冠狀病毒Coronavirus由所謂的血清學分類成alpha, beta, gamma, delta,會感染人類的則以beta和alpha為主。其為一種RNA病毒且具有套膜,基因序列大小在27 - 32 kb之間,最常見的是229E、OC43、NL63、HKU1這四株病毒。這次武漢肺炎背後的病毒已經被WHO命名為2019-nCoV(2019新型冠狀病毒)。
補充:武漢肺炎已經被疾病管制局列為第五類法定傳染病,並且叫嚴重特殊傳染性肺炎,基本上,疾病管制局有公布相關採檢檢驗的規範,指定之實驗室外是不能做病毒培養的!
所以千萬別在懷疑的病人就給他開立Viral culture,一定要跟院內檢驗科室確認清楚!
## 最新資訊請關注疾病管制局的消息,別輕信社交軟件的"
聽說",否則易引起不必要的恐慌!
https://www.cdc.gov.tw/Cate…/NewsPage/EmXemht4IT-IRAPrAnyG9A
#labmed
http://virological.org/t/novel-2019-coronavirus-genome/319
https://www.cdc.gov.tw/Category/List/AuFztf_j5e4MaYz-sjteNQ
https://nextstrain.org/groups/blab/sars-like-cov
更新 2020/01/21:Nextstrain網站上已有針對2019新型冠狀病毒的品系追蹤 https://nextstrain.org/ncov#pathogens
同時也有54部Youtube影片,追蹤數超過3萬的網紅XXY_Animal of Vision,也在其Youtube影片中提到,00:00:00 開場引言 00:03:05 基本評分(無雷) 00:16:39 劇情討論(有雷) 00:48:33 推薦或退件時間 【梗你評電影】《哥吉拉 奇異點》Godzilla Singular Point 看完腦漿爆發的怪獸影集 || PODCAST XXY + Jericho . ▶ ...
生物資訊領域 在 FundDJ基智網 Facebook 的最佳解答
【新兵報到】鎖定個人健康雲 創源志在成領導廠商
訊聯子公司創源成立於2008年,目前資本額2億元,是訊聯與美國遺傳基因診斷權威美國GGI合作共同創立,藉此引進PGD 胚胎著床前基因診斷及Genesis-24胚胎著床前晶片篩檢技術;而訊聯在創源掛牌上櫃前持股比例達19.35%。
創源目前產品在國內新生兒滲透率超過5成,明(2013)年上半年預計推出新生兒藥物過敏檢測產品,年底完成新生兒全基因定序,在龐大的基因資料庫基礎下,目標發展成為國內個人健康雲的領導廠商,並開展全球首創的「生技雙軌銀行」。
目前創源產品線,主要包括孕前階段的胚胎著床前基因檢測/胚胎著床前晶片篩檢;產前階段的羊水染色體晶片篩檢/脊髓性肌肉萎縮症基因檢測;分子診斷的核酸檢測;另有發展個人化醫療相關的單一核甘酸多型性分析、全基因體定序資料分析、自體顯性多囊性腎臟疾病基因檢測等。
除設有檢測部門外,該公司還成立生物資訊及健康照護部門,去年併購台灣雲端運算技術與應用聯盟(ACCTA)創始會員之一的分子視算公司,快速進入生物資訊領域,拓展個人化醫療市場。
創源執行長蔡政憲指出,今年上半年國內新生兒數約11萬,與該公司檢測及幹細胞儲存等產品往來的客戶ID超過5.5萬,在新生兒市場滲透率超過5成,部分往來產品還不只一份,以未來每年新增新生兒資料庫至少10萬人次,並連結到直系血親的擴張速度估算,基因資料庫擴張的速度可觀,會是發展「個人健康雲」的強建基礎。
蔡政憲表示,隨生技醫療技術的進步,健康雲的發展已逐漸親民化,對消費者來說,最早一年可能動輒數百萬至千萬元,才能提供從基因定序至終其一生的個人化醫療建議,現階段只需幾十萬元,這將替全球生技醫療產業帶來革命性突破;該公司也預計耗時6年建置成為國內健康雲的領導廠商。他指出,明年上半年還將推出新生兒藥物篩檢檢測服務,年底完成新生兒全基因定序。
訊聯總經理劉天來指出,以該集團檢測產品來說,唐氏症在新生兒滲透率已達41%,脊髓肌肉萎縮症(SMA)的滲透率也有25-26%,將透過結合創源的「生命資訊銀行」與訊聯的「幹細胞銀行」,共同構築為個人終生健康守護概念的「生技雙軌銀行」。
除國內市場外,創源今年2月也開始與日本知名的不孕中心IVF JAPAN Group合作,將客戶檢體送至該公司進行「胚胎著床前基因診斷」及「G-24胚胎著床前晶片篩檢」兩項檢測,因該集團旗下擁有IVF Osaka 及IVF Namba兩家大型診所,集團全年人工生殖週數高達6,000次,占台灣全年整體人工生殖週數3/4,也被視作是國內生醫技術輸出的重大突破,其他市場也透過與中國大陸壽星寶生物科技及巴拿馬Cordon de Vida等的技術移轉,來增加海外營收。
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生物資訊領域 在 XXY_Animal of Vision Youtube 的精選貼文
00:00:00 開場引言
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【梗你評電影】《哥吉拉 奇異點》Godzilla Singular Point
看完腦漿爆發的怪獸影集 || PODCAST XXY + Jericho
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▶ 收看YouTube影片:https://youtu.be/XfPibnFKvJo
▶ 收聽PODCAST聲音:https://open.firstory.me/story/ckquksu3t5sul081861g7tbod/platforms
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歡迎收看/收聽【梗你評電影】單元,我們每個禮拜透過討論的方式來解析、評論電影的優缺點,讓你看電影更有梗!
這次【梗你評電影】要來評的是影集《哥吉拉 奇異點》;這是日本東寶所製作哥吉拉系列作品裡第一部動畫影集,於2021年4月1日起於日本東京都會電視台首播,並於六月全球Netflix上架。故事以2030年的近未來為時空設定,採兩條主要故事線進行:分別描述一位專門研究非現實存在生物的天才女研究生 神野銘,以及滿腹理想卻不善交際的少年 有川潤,兩人各自在工作領域中發現一種未知來源的神秘訊號,關係著威脅世界各地正發生的怪獸攻擊事件。
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本部影集由吉卜力工作室出身的導演 高橋敦史所執導,以及日本科幻小說家 圓城塔操刀劇本,劇中充滿大量的科學理論,以及致敬過去哥吉拉系列作品的怪獸,讓科幻或是怪獸迷相當著迷。以象徵「破壞神」的哥吉拉,和理論科學中的「奇異點」概念結合,闡述了人類世界面臨重大災難,及探索未知領域時的反應和態度,讓《哥吉拉 奇異點》的整體調性有別於過去追求聲光娛樂效果的怪獸題材作品。
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不論你對《哥吉拉 奇異點》這齣影集是喜歡還是不喜歡,都歡迎你一同來與我們討論唷!
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生物資訊領域 在 陳其邁 Youtube 的最佳貼文
我身為醫師,了解醫護人員辛苦。
但是從公衛專業,疫調牽涉到整個疫情傳播,所以疫調、匡列、隔離非常的重要。
這個個案到高雄,只是少數個案,因為高雄跑到新北看病的人不多。
但是可以試想,這些同一時間當然一定有不少同樣的個案沒抓到,在北部地區傳播所帶來的風險如何?所以,這必須靠疫調來補強。所以既然有疏漏,就應該把漏洞趕快補起來。
從市長角度來看,我做為地方指揮官,相信每個地方首長跟我一樣,都希望把防疫工作做好,防疫缺口都要補齊,假如高雄市防疫有哪邊需要指教,我們都會虛心接受。
以高雄狀況,我們在群聚感染的時候,第一個必須要很快找到感染源,第二個也快速地疫調匡列隔離,讓社區風險降到最低。
我們的疫調人員,很辛苦,提供更多更清楚的資訊有助於疫情的掌握,當然就可以抑制疫情的傳播。
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今天全國76例,高雄有2例。
這2例還是屬於新北地區恩主公醫院的南北移動,所造成的家庭群聚感染。
因為彼此親屬之間互動,造成整個包括原來一開始2個家庭,到今天為止5個家庭感染,大概已是第三波的群聚感染。這也是為什麼我們在進行疫調的時候,必須是要超前部署、加快匡列,這2個確診的個案,也是屬於我們匡列範圍內。
從疫調資料發現,密閉空間長時間接觸,像家庭、工作場所,風險很高。
所以再次特別提醒大家:最好這段時間不要有訪客,真的有很重要的事情,也拜託非同住者,進到屋內的時候,一定要戴上口罩、保持社交距離。
我們也要特別感謝日本,在七月中將捐贈一百萬劑AZ疫苗會來到台灣。
患難見真情,感謝日本的朋友。
也要告訴大家 75歲以上的長輩,假如你還沒有打疫苗的,每一個社區未來開放施打的時候,都能到各接種站補打。
假如有不清楚的地方、或者需要預約接送,可以跟區公所聯絡,我們會全力服務大家。
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屏東祖孫感染的印度變種病毒,是世界衛生組織「高度關注」的變種病毒株。
其中Alpha屬於英國的,包括雙北地區,很多流行的病毒株就是屬於英國變種病毒株。Delta,是印度的變種病毒株,英國原來要解封,但是發現流行的病毒株由印度變種病毒株取代,所以延後解封的時間。
武漢肺炎當時在武漢地區,R值是2.4到2.6個人,換句話說一人傳給大概2.5人;歐洲引發第一波疫情的病毒株,大概是一個人傳給3個人。
Alpha的英國變種病毒株是4到5,一個人傳給5個人,印度的Delta變種病毒株是5到8個人,所以它的傳播力會越來越強,為什麼會這樣?因為RNA的病毒非常容易發生變異,發生變異時,就會有新舊病毒的競爭,當然越會傳播的病毒就會勝出。
從這個群聚感染的個案,可以看出,以在家族的傳播,如果是英國的變種病毒株,整個家庭全部都有。
那再想想看:R0=5~8的印度變種病毒株會怎麼樣?傳播力一定是會更強,所以我們一定要去施打疫苗。
很多人說「等一下再打」,但從國外的經驗來看,AZ疫苗對印度的兩種變種病毒都有效,Kappa、Delta、或者Alpha病毒都有效,所以不要挑疫苗,就趕快去打,相關臨床數字來看,對於降低重症、死亡的比率都超過9成保護力。疫苗該輪到你打的時候,你就去打。
屏東部分,我們已經在昨天就已經啟動專案,也跟我們所有果菜市場、農會造冊,包括貨運司機總共有13位,相關往來攤商,我們就通知他們來採檢PCR。另外對於大型的這些蔬果市場,包括果菜市場、肉品、民生物資供應站部分,我們也在造冊準備排定施打疫苗,這是我們的做法。
大家常問:「印度病毒變種株進來怎麼辦?」第一,疫苗趕快打。
第二,落實疫調、匡列、隔離。
常講這張圖 R=5,20天後就是625個。
看疫調資料,我們都覺得如果以流行病學醫學領域來談,病毒傳播這麼快的,應該是一百年前的流感大流行。
老話一句,疫苗覆蓋率不足情況之下,疫調匡列隔離,我們R=5 匡列八成,R=8應該要匡列更多人,對疫調要非常嚴峻及務必要落實。否則疫情恐怕離恢復正常生活需要一段時間。
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⭐本週六日孕婦接種COVID-19疫苗服務
提醒要打疫苗的懷孕婦女,先跟做產檢醫師討論、評估喔!
- 6/26、6/27下午14:00-16:30
- 於巨蛋體育館、鳳山體育館
- 請欲接種孕婦,撥打07-8220300預約
- 接種當日請攜帶健保卡、媽媽手冊、原產科醫師開立之「轉診單」
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📢 公佈今日(6/25)確診個案在高雄市的公共場所活動史
https://reurl.cc/3aX9RM
提醒曾經於附表中時間地點活動的民眾,請進行自我健康監測,如有出現相關症狀,請撥打1922、或者衛生局防疫專線07-7230250。
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